Морской транспорт играет важную роль в развитии экономики страны и решающую роль в транспортном обеспечении её внешнеэкономических связей, что выражается в решении им следующих основных задач:
- выполнении экспортно-импортных, транзитных и каботажных (в том числе арктических) морских перевозок;
- транспортном обслуживании труднодоступных районов Крайнего Севера и Дальнего Востока, где морской транспорт является практически единственным видом транспорта, способным перевозить крупные партии грузов, обеспечивая тем самым жизнедеятельность малых народов и освоение природных богатств обширных регионов страны;
- обеспечении транспортной связи с анклавной Калининградской областью без пересечения территорий других стран;
- выполнении функции резерва Военно-Морского флота России.